Dyrektorem Urzędu Żeglugi Śródlądowej w Szczecinie jest dr inż. Piotr Durajczyk
Dyrektor Urzędu Żeglugi Śródlądowej jest terenowym organem administracji publicznej w zakresie żeglugi śródlądowej podległy bezpośrednio Ministrowi Infrastruktury i Rozwoju.
Dyrektor Urzędu Żeglugi Śródlądowej, w zakresie swego działania, podejmuje decyzje administracyjne i postanowienia.
W czasie nieobecności dyrektora Urzędu zastępuje go wyznaczony przez niego pracownik.
Organizację i technikę pracy biurowej w Urzędzie reguluje instrukcja kancelaryjna wprowadzona Zarządzeniem nr 2/2001 Dyrektora Urzędu Żeglugi Śródlądowej Szczecinie z dnia 15.10.2001 r.
Szczegółowe zakresy zadań służbowych pracowników określają karty stanowisk pracy..